Foi através das tecnologias de sequenciação de nova geração e da análise bioinformática, disponíveis na INSaFLU (“INSide the FLU”), que os investigadores do Instituto Dr. Ricardo Jorge amplificaram laboratorialmente o material genético do vírus que permitiu identificar a sequência completa do genoma dos primeiros casos do vírus em Portugal.

Esta plataforma inicialmente desenvolvida para o vírus da Gripe, foi criada pelo Núcleo de Bioinformática e pelo Laboratório Nacional de Referência para o Vírus da Gripe, sob a coordenação do investigador Vítor Borges e com o contributo do bioinformático Miguel Pinheiro (Universidade de Aveiro) e é, segundo o Instituto Nacional de Saude Dr. Ricardo Jorge, uma plataforma online de livre acesso e de “fácil utilização para a integração da análise total do genoma do vírus influenza na vigilância da gripe, obedecendo às recomendações das autoridades de Saúde mundiais”.

A identificação no genoma do vírus é importante na compreensão do surto nomeadamente ao nível da determinação da sua origem. Os vírus sofrem várias mutações que podem não afetar as características, sintomas ou efeitos  causados, mas que ajudam no rastreamento e entendimento da propagação da doença, que por sua vez se revelam fundamentais na contenção e controlo de futuros surtos.

Esses resultados foram também partilhados a nível mundial nas plataformas online Nextstrain e no repositório GISAID, que são também plataformas de partilha abertas que promovem avanços conjuntos.

A Gisaid é essencialmente uma plataforma de partilha de genomas. Enquanto a Nextstrain estuda a evolução de vírus e bactérias. A Nextsrain permite, por exemplo, visualizar de forma rápida a propagação do vírus pelas diversas regiões enquanto permite perceber como os surtos locais estão conectados. Sendo uma tecnologia Open Source, todos os investigadores podem utilizar o código para os mais variados tipos de projectos de investigação, que por sua vez podem contribuir para um avanço favorável do panorama.

Apesar do genoma do vírus ser conhecido, os padrões de disseminação ainda não são claros e estas plataformas podem vir a desempenhar um papel chave no desenvolvimento de soluções, nomeadamente por contribuir para o desenvolvimento de medidas profiláticas (vacinas) e ajudar a direcionar as terapêuticas administradas.